莲音和法音在不可思议的星球上拯救了“阳光”，找到了人与人之间的纽带。两位公主离开了不可思议的星球，前往皇家奇幻星球上的“皇家魔法学院”学习。这所学校是一所寄宿学校，希望成为王后和国王的各国（星球）的公主和王子聚集在一起。连胤和法胤在那里，急切地想结交新朋友。然而，爱钱的导演，待人冷漠的学姐，一堆讨厌的校规，阻碍了两人的发展。Plus成绩是使用竞争积分系统计算的，周围有很多竞争，更不用说交朋友了。学校礼堂里有一个太阳钟。据说敲响它可以变身为宇宙中独一无二的“宇宙公主”，但至今没有人这部剧场版的开头就是以小兰的梦境展开的，梦中小兰的妈妈中了枪，而引出了后来小兰父母分居的原因。而后在小兰的安排下，小兰父母在一起用了晚餐，开始的氛围还挺温馨的，而后却因为毛利小五郎的言语而不欢而散了。再之后就是整个故事正式开始上演。首先受伤的就是目暮十三，也就是目暮警官，是射杀；接下来就是妃英理，是毒杀；在接下来是阿笠博士，是再一次的射杀。然后通过三次留在现场的证物，柯南断定和扑克牌有关。不过我一直觉得阿笠博士和11的那个联系其实挺牵强的。当然这一切就引出了十年前的案件，引出了那一段往事，那一段不愿回忆的往事在那个危险的时候，毛利小五郎用枪射伤了被村上丈绑做人质的妃英理，而后又打伤了罪犯，并将其绳之以法了。而回忆起过去的小兰误以为母亲离开父亲的原因是因为那一枪，而十分难过。不过最后她还是明白了，因为柯南的那一枪。不过我是真没想到毛利小五郎恐高那么严重，看他上直升飞机后那个表情，还以为是要去地狱了呢。还有一点我很想说柯南的剧场版破坏性是不是太强了。